研究报告/ Research Report

新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息学分析  

郭龙1 , 李月1 , 姚正培1 , 徐叶挺2 , 罗淑萍1 , 刘鹏程1 , 代培红1*
1新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐, 830052;
2新疆农业科学院园艺作物研究所, 乌鲁木齐, 830091
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 22 篇   
收稿日期: 2016年04月29日    接受日期: 2016年05月16日    发表日期: 2016年06月16日
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摘要

以野扁桃为实验材料,提取叶片的RNA,设计基因特异性引物,利用RT-PCR克隆转录因子CBFcDNA全长,命名为AlsCBF1-A (登录号KU975456);并对起基因和蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,该转录因子基因的CDS区长699bp,编码232个氨基酸,编码蛋白相对分子质量约为26.0272 kDaPI 4.84;由无规则卷曲(C)α-螺旋(H)β-折叠(E)组成,分别占52.17%21.74%26.09%;有较强的亲水性,无跨膜区和信号肽存在,有8处丝氨酸磷酸化位点、2处苏氨酸磷酸化位点、2处酪氨酸磷酸化位点;同源性分析表明AlsCBF1-A基因在高等植物中保守性较高。本研究显示CBF转录因子可能与野扁桃的抗寒性相关,此研究为野扁桃抗寒分子机理的进一步研究提供了帮助。

关键词
野扁桃; 转录因子;CBF基因;抗寒

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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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